Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AMPD1P23109 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AMPD1P23109 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms