Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC2P18074 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms