Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRFP11831 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRFP11831 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRFP11831 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRFP11831 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRFP11831 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SRFP11831 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRFP11831 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRFP11831 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRFP11831 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRFP11831 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRFP11831 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRFP11831 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRFP11831 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRFP11831 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRFP11831 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRFP11831 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRFP11831 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRFP11831 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRFP11831 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRFP11831 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRFP11831 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRFP11831 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRFP11831 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRFP11831 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRFP11831 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SRFP11831 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRFP11831 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRFP11831 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRFP11831 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRFP11831 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SRFP11831 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRFP11831 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRFP11831 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRFP11831 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRFP11831 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRFP11831 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRFP11831 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRFP11831 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRFP11831 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRFP11831 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRFP11831 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRFP11831 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRFP11831 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRFP11831 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRFP11831 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRFP11831 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRFP11831 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRFP11831 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRFP11831 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRFP11831 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRFP11831 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRFP11831 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRFP11831 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRFP11831 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SRFP11831 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRFP11831 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRFP11831 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRFP11831 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRFP11831 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRFP11831 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRFP11831 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRFP11831 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRFP11831 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRFP11831 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRFP11831 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRFP11831 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRFP11831 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRFP11831 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRFP11831 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRFP11831 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRFP11831 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRFP11831 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRFP11831 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRFP11831 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRFP11831 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRFP11831 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRFP11831 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRFP11831 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRFP11831 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRFP11831 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRFP11831 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRFP11831 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRFP11831 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRFP11831 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRFP11831 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRFP11831 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRFP11831 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRFP11831 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRFP11831 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SRFP11831 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRFP11831 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRFP11831 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRFP11831 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRFP11831 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRFP11831 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRFP11831 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRFP11831 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRFP11831 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRFP11831 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms