Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
EPB41P11171 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPB41P11171 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPB41P11171 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPB41P11171 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPB41P11171 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPB41P11171 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPB41P11171 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPB41P11171 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPB41P11171 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPB41P11171 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPB41P11171 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPB41P11171 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPB41P11171 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPB41P11171 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPB41P11171 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPB41P11171 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPB41P11171 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPB41P11171 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPB41P11171 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPB41P11171 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPB41P11171 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPB41P11171 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPB41P11171 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPB41P11171 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPB41P11171 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EPB41P11171 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPB41P11171 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPB41P11171 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPB41P11171 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPB41P11171 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPB41P11171 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPB41P11171 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPB41P11171 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPB41P11171 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPB41P11171 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPB41P11171 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPB41P11171 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPB41P11171 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPB41P11171 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EPB41P11171 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPB41P11171 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPB41P11171 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPB41P11171 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPB41P11171 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPB41P11171 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPB41P11171 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPB41P11171 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPB41P11171 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPB41P11171 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPB41P11171 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EPB41P11171 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPB41P11171 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPB41P11171 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPB41P11171 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPB41P11171 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPB41P11171 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPB41P11171 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPB41P11171 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EPB41P11171 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPB41P11171 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPB41P11171 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPB41P11171 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPB41P11171 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPB41P11171 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPB41P11171 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EPB41P11171 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPB41P11171 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPB41P11171 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPB41P11171 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPB41P11171 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPB41P11171 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPB41P11171 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPB41P11171 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPB41P11171 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPB41P11171 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPB41P11171 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPB41P11171 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPB41P11171 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPB41P11171 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPB41P11171 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPB41P11171 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPB41P11171 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPB41P11171 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EPB41P11171 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EPB41P11171 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EPB41P11171 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPB41P11171 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPB41P11171 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPB41P11171 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPB41P11171 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPB41P11171 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPB41P11171 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPB41P11171 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPB41P11171 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPB41P11171 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPB41P11171 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPB41P11171 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPB41P11171 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPB41P11171 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms