Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
GLI2P10070 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
GLI2P10070 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
GLI2P10070 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
GLI2P10070 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
GLI2P10070 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
GLI2P10070 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
GLI2P10070 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
GLI2P10070 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
GLI2P10070 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
GLI2P10070 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
GLI2P10070 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
GLI2P10070 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
GLI2P10070 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
GLI2P10070 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
GLI2P10070 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
GLI2P10070 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
GLI2P10070 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
GLI2P10070 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
GLI2P10070 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
GLI2P10070 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
GLI2P10070 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
GLI2P10070 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
GLI2P10070 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
GLI2P10070 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
GLI2P10070 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
GLI2P10070 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
GLI2P10070 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
GLI2P10070 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
GLI2P10070 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
GLI2P10070 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
GLI2P10070 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
GLI2P10070 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
GLI2P10070 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
GLI2P10070 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
GLI2P10070 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
GLI2P10070 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
GLI2P10070 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
GLI2P10070 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
GLI2P10070 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
GLI2P10070 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
GLI2P10070 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
GLI2P10070 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
GLI2P10070 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
GLI2P10070 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
GLI2P10070 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
GLI2P10070 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
GLI2P10070 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
GLI2P10070 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
GLI2P10070 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
GLI2P10070 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
GLI2P10070 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
GLI2P10070 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
GLI2P10070 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
GLI2P10070 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
GLI2P10070 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
GLI2P10070 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
GLI2P10070 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
GLI2P10070 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
GLI2P10070 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
GLI2P10070 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
GLI2P10070 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
GLI2P10070 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC35.17■■■■□ 3.22
GLI2P10070 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
GLI2P10070 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
GLI2P10070 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
GLI2P10070 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
GLI2P10070 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
GLI2P10070 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
GLI2P10070 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
GLI2P10070 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
GLI2P10070 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
GLI2P10070 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
GLI2P10070 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
GLI2P10070 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
GLI2P10070 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
GLI2P10070 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
GLI2P10070 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
GLI2P10070 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
GLI2P10070 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
GLI2P10070 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC35.13■■■■□ 3.21
GLI2P10070 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
GLI2P10070 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
GLI2P10070 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
GLI2P10070 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
GLI2P10070 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
GLI2P10070 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
GLI2P10070 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
GLI2P10070 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
GLI2P10070 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
GLI2P10070 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
GLI2P10070 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
GLI2P10070 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
GLI2P10070 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
GLI2P10070 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
GLI2P10070 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
GLI2P10070 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
GLI2P10070 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
GLI2P10070 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC35.11■■■■□ 3.21
GLI2P10070 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms