Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RGPD1P0DJD0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RGPD1P0DJD0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RGPD1P0DJD0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RGPD1P0DJD0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RGPD1P0DJD0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RGPD1P0DJD0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RGPD1P0DJD0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RGPD1P0DJD0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RGPD1P0DJD0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RGPD1P0DJD0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RGPD1P0DJD0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RGPD1P0DJD0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RGPD1P0DJD0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RGPD1P0DJD0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RGPD1P0DJD0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RGPD1P0DJD0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
RGPD1P0DJD0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RGPD1P0DJD0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RGPD1P0DJD0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
RGPD1P0DJD0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
RGPD1P0DJD0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
RGPD1P0DJD0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
RGPD1P0DJD0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
RGPD1P0DJD0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RGPD1P0DJD0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RGPD1P0DJD0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RGPD1P0DJD0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RGPD1P0DJD0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RGPD1P0DJD0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RGPD1P0DJD0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RGPD1P0DJD0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RGPD1P0DJD0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RGPD1P0DJD0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RGPD1P0DJD0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RGPD1P0DJD0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RGPD1P0DJD0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RGPD1P0DJD0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RGPD1P0DJD0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RGPD1P0DJD0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RGPD1P0DJD0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms