Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRM2P04554 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRM2P04554 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRM2P04554 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRM2P04554 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRM2P04554 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRM2P04554 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRM2P04554 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRM2P04554 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRM2P04554 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRM2P04554 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRM2P04554 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRM2P04554 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRM2P04554 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRM2P04554 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRM2P04554 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRM2P04554 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRM2P04554 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRM2P04554 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRM2P04554 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRM2P04554 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRM2P04554 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRM2P04554 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRM2P04554 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRM2P04554 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRM2P04554 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRM2P04554 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRM2P04554 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRM2P04554 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRM2P04554 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRM2P04554 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRM2P04554 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRM2P04554 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRM2P04554 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRM2P04554 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRM2P04554 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRM2P04554 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRM2P04554 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRM2P04554 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRM2P04554 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRM2P04554 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRM2P04554 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRM2P04554 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRM2P04554 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRM2P04554 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRM2P04554 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRM2P04554 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRM2P04554 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRM2P04554 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRM2P04554 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRM2P04554 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRM2P04554 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRM2P04554 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRM2P04554 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRM2P04554 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRM2P04554 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRM2P04554 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRM2P04554 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRM2P04554 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRM2P04554 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRM2P04554 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRM2P04554 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRM2P04554 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRM2P04554 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRM2P04554 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRM2P04554 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRM2P04554 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRM2P04554 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRM2P04554 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRM2P04554 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRM2P04554 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRM2P04554 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRM2P04554 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRM2P04554 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRM2P04554 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRM2P04554 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRM2P04554 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRM2P04554 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRM2P04554 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRM2P04554 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRM2P04554 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRM2P04554 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRM2P04554 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRM2P04554 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRM2P04554 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRM2P04554 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRM2P04554 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRM2P04554 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRM2P04554 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRM2P04554 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRM2P04554 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRM2P04554 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRM2P04554 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRM2P04554 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRM2P04554 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRM2P04554 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRM2P04554 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRM2P04554 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRM2P04554 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRM2P04554 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms