Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN9O95484 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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