Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ECM2O94769 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ECM2O94769 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ECM2O94769 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ECM2O94769 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ECM2O94769 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ECM2O94769 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ECM2O94769 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ECM2O94769 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECM2O94769 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECM2O94769 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECM2O94769 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECM2O94769 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECM2O94769 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECM2O94769 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECM2O94769 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM2O94769 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM2O94769 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM2O94769 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM2O94769 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM2O94769 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM2O94769 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM2O94769 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM2O94769 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM2O94769 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM2O94769 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM2O94769 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM2O94769 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM2O94769 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECM2O94769 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ECM2O94769 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ECM2O94769 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ECM2O94769 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ECM2O94769 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ECM2O94769 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ECM2O94769 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ECM2O94769 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ECM2O94769 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ECM2O94769 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ECM2O94769 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ECM2O94769 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ECM2O94769 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ECM2O94769 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ECM2O94769 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ECM2O94769 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ECM2O94769 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ECM2O94769 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ECM2O94769 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ECM2O94769 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ECM2O94769 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ECM2O94769 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ECM2O94769 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECM2O94769 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECM2O94769 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECM2O94769 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECM2O94769 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECM2O94769 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECM2O94769 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECM2O94769 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ECM2O94769 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECM2O94769 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECM2O94769 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECM2O94769 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECM2O94769 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECM2O94769 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECM2O94769 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECM2O94769 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECM2O94769 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECM2O94769 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECM2O94769 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ECM2O94769 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ECM2O94769 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ECM2O94769 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ECM2O94769 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ECM2O94769 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ECM2O94769 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ECM2O94769 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ECM2O94769 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ECM2O94769 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ECM2O94769 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ECM2O94769 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ECM2O94769 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ECM2O94769 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ECM2O94769 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ECM2O94769 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ECM2O94769 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ECM2O94769 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ECM2O94769 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ECM2O94769 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ECM2O94769 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ECM2O94769 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ECM2O94769 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ECM2O94769 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ECM2O94769 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ECM2O94769 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ECM2O94769 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ECM2O94769 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ECM2O94769 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ECM2O94769 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ECM2O94769 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms