Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRP5O75197 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRP5O75197 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRP5O75197 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRP5O75197 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRP5O75197 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRP5O75197 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRP5O75197 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRP5O75197 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRP5O75197 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRP5O75197 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRP5O75197 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRP5O75197 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRP5O75197 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRP5O75197 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRP5O75197 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
LRP5O75197 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRP5O75197 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRP5O75197 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRP5O75197 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRP5O75197 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRP5O75197 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRP5O75197 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRP5O75197 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRP5O75197 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRP5O75197 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRP5O75197 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LRP5O75197 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRP5O75197 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRP5O75197 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRP5O75197 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRP5O75197 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRP5O75197 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRP5O75197 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRP5O75197 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRP5O75197 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRP5O75197 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRP5O75197 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
LRP5O75197 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRP5O75197 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRP5O75197 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRP5O75197 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
LRP5O75197 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRP5O75197 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRP5O75197 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRP5O75197 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRP5O75197 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRP5O75197 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRP5O75197 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRP5O75197 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRP5O75197 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
LRP5O75197 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRP5O75197 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRP5O75197 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRP5O75197 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRP5O75197 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRP5O75197 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRP5O75197 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRP5O75197 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRP5O75197 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRP5O75197 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRP5O75197 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRP5O75197 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRP5O75197 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRP5O75197 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRP5O75197 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRP5O75197 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRP5O75197 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRP5O75197 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRP5O75197 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRP5O75197 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRP5O75197 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRP5O75197 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
LRP5O75197 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRP5O75197 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRP5O75197 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRP5O75197 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRP5O75197 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRP5O75197 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRP5O75197 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRP5O75197 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRP5O75197 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
LRP5O75197 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRP5O75197 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRP5O75197 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRP5O75197 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
LRP5O75197 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRP5O75197 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRP5O75197 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRP5O75197 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRP5O75197 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRP5O75197 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRP5O75197 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRP5O75197 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRP5O75197 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRP5O75197 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRP5O75197 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRP5O75197 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRP5O75197 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRP5O75197 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms