Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPFIA3O75145 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms