Protein–RNA interactions for Protein: O75132

ZBED4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED4O75132 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms