Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX2O60749 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX2O60749 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX2O60749 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX2O60749 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX2O60749 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX2O60749 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX2O60749 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX2O60749 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX2O60749 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX2O60749 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX2O60749 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX2O60749 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX2O60749 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX2O60749 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX2O60749 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX2O60749 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX2O60749 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX2O60749 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX2O60749 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX2O60749 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX2O60749 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX2O60749 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX2O60749 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX2O60749 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNX2O60749 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX2O60749 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX2O60749 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX2O60749 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX2O60749 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX2O60749 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX2O60749 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX2O60749 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX2O60749 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX2O60749 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX2O60749 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX2O60749 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX2O60749 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX2O60749 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX2O60749 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX2O60749 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX2O60749 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX2O60749 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX2O60749 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX2O60749 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX2O60749 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX2O60749 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX2O60749 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX2O60749 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX2O60749 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX2O60749 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX2O60749 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX2O60749 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX2O60749 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX2O60749 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX2O60749 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX2O60749 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX2O60749 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX2O60749 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX2O60749 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX2O60749 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX2O60749 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX2O60749 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX2O60749 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX2O60749 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX2O60749 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX2O60749 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX2O60749 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX2O60749 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX2O60749 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX2O60749 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX2O60749 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX2O60749 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX2O60749 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX2O60749 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX2O60749 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX2O60749 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX2O60749 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX2O60749 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX2O60749 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX2O60749 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX2O60749 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX2O60749 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX2O60749 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX2O60749 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX2O60749 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX2O60749 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX2O60749 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX2O60749 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX2O60749 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX2O60749 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX2O60749 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX2O60749 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX2O60749 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX2O60749 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX2O60749 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX2O60749 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX2O60749 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNX2O60749 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNX2O60749 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms