Protein–RNA interactions for Protein: O43809

NUDT21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT21O43809 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUDT21O43809 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUDT21O43809 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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