Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SYNMO15061 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SYNMO15061 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SYNMO15061 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SYNMO15061 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SYNMO15061 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SYNMO15061 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SYNMO15061 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SYNMO15061 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SYNMO15061 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SYNMO15061 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SYNMO15061 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SYNMO15061 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
SYNMO15061 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SYNMO15061 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SYNMO15061 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SYNMO15061 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SYNMO15061 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
SYNMO15061 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SYNMO15061 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SYNMO15061 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
SYNMO15061 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.01■■■□□ 2.88
SYNMO15061 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SYNMO15061 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SYNMO15061 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SYNMO15061 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SYNMO15061 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
SYNMO15061 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SYNMO15061 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SYNMO15061 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SYNMO15061 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SYNMO15061 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SYNMO15061 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SYNMO15061 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
SYNMO15061 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC33■■■□□ 2.87
SYNMO15061 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SYNMO15061 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SYNMO15061 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SYNMO15061 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SYNMO15061 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SYNMO15061 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SYNMO15061 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SYNMO15061 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SYNMO15061 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SYNMO15061 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SYNMO15061 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
SYNMO15061 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SYNMO15061 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SYNMO15061 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SYNMO15061 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SYNMO15061 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SYNMO15061 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SYNMO15061 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SYNMO15061 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SYNMO15061 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SYNMO15061 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SYNMO15061 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SYNMO15061 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
SYNMO15061 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SYNMO15061 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SYNMO15061 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SYNMO15061 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SYNMO15061 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SYNMO15061 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SYNMO15061 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SYNMO15061 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SYNMO15061 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SYNMO15061 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SYNMO15061 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
SYNMO15061 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SYNMO15061 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
SYNMO15061 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SYNMO15061 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SYNMO15061 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
SYNMO15061 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
SYNMO15061 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
SYNMO15061 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SYNMO15061 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
SYNMO15061 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SYNMO15061 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SYNMO15061 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
SYNMO15061 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SYNMO15061 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
SYNMO15061 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SYNMO15061 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SYNMO15061 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SYNMO15061 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SYNMO15061 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SYNMO15061 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SYNMO15061 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SYNMO15061 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SYNMO15061 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SYNMO15061 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SYNMO15061 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SYNMO15061 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SYNMO15061 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
SYNMO15061 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SYNMO15061 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SYNMO15061 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SYNMO15061 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms