Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3B1O00203 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms