Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms