Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf170A2RU37 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf170A2RU37 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms