Protein–RNA interactions for Protein: A0A599

TCRBV5S2, T-cell receptor beta variable 5-6 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S2A0A599 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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TCRBV5S2A0A599 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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TCRBV5S2A0A599 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCRBV5S2A0A599 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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TCRBV5S2A0A599 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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TCRBV5S2A0A599 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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TCRBV5S2A0A599 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCRBV5S2A0A599 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCRBV5S2A0A599 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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TCRBV5S2A0A599 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCRBV5S2A0A599 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCRBV5S2A0A599 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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TCRBV5S2A0A599 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCRBV5S2A0A599 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCRBV5S2A0A599 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCRBV5S2A0A599 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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TCRBV5S2A0A599 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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TCRBV5S2A0A599 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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TCRBV5S2A0A599 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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TCRBV5S2A0A599 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCRBV5S2A0A599 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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TCRBV5S2A0A599 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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TCRBV5S2A0A599 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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TCRBV5S2A0A599 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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TCRBV5S2A0A599 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCRBV5S2A0A599 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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