Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A0D9SFI3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms