Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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