Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

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Length 1,284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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COL20A1Q9P218 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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COL20A1Q9P218 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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COL20A1Q9P218 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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COL20A1Q9P218 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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COL20A1Q9P218 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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COL20A1Q9P218 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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COL20A1Q9P218 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL20A1Q9P218 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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