Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms