Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
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