Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCOF1Q13428 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms