Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms