Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI1P08151 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI1P08151 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI1P08151 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI1P08151 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI1P08151 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI1P08151 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI1P08151 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI1P08151 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI1P08151 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI1P08151 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI1P08151 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI1P08151 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI1P08151 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI1P08151 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI1P08151 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI1P08151 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI1P08151 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI1P08151 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI1P08151 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI1P08151 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI1P08151 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GLI1P08151 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms