Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
NRF1Q16656 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NRF1Q16656 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms