Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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CTF1Q16619 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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CTF1Q16619 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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CTF1Q16619 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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CTF1Q16619 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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CTF1Q16619 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 GRM4-209ENST00000609222 3176 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 CTAGE13P-201ENST00000416709 2446 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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