Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SIX1Q15475 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SIX1Q15475 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SIX1Q15475 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SIX1Q15475 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SIX1Q15475 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SIX1Q15475 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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SIX1Q15475 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SIX1Q15475 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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