Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ACTA1P68133 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms