Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCP1P17987 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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