Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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