Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LPIN3Q9BQK8 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms