Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms