Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf17Q53FE4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms