Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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