Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK17Q00537 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms