Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRXP46100 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRXP46100 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRXP46100 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRXP46100 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATRXP46100 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ATRXP46100 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ATRXP46100 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ATRXP46100 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ATRXP46100 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ATRXP46100 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ATRXP46100 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ATRXP46100 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
ATRXP46100 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ATRXP46100 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ATRXP46100 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ATRXP46100 TMEM256P1-201ENST00000430550 340 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AC139143.1-201ENST00000441772 1207 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
ATRXP46100 SPATA24-204ENST00000507779 606 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
ATRXP46100 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ATRXP46100 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ATRXP46100 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 RPS15P5-201ENST00000449885 432 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 CHCHD2P6-201ENST00000454346 447 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AP001922.6-201ENST00000532553 546 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AL603832.3-203ENST00000606505 813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AC127002.1-201ENST00000619123 455 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRXP46100 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 MIR4435-2HG-201ENST00000308604 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AC138392.1-201ENST00000427577 921 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 IFNWP19-201ENST00000438727 566 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AP001979.2-201ENST00000526254 975 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRXP46100 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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