Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GGCXP38435 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms