Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms