Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms