Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms