Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms