Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms