Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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SGF29Q96ES7 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SGF29Q96ES7 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SGF29Q96ES7 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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