Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 MGAT4EP-201ENST00000330493 2810 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 FBXO44-202ENST00000251547 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 GGTA1P-202ENST00000481534 3429 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 FAM198B-207ENST00000592057 3425 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms