Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms