Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HTR4Q13639 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms