Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms